跨境电商不断发展，给税收征管模式也带来很多问题。
第一票据问题。跨境电商企业的商品一般是由个体经营户提供的，也就是市场中的小规模纳税人，一般是没办法自行开具增值税专用发票的。所以，对跨境电商企业来说，获得增值税专用发票是比较困难的。并且因为跨境电商企业一般销售的商品都是以快件方式出镜，所以出口商品时，没办法提供装货单等相关的备案单证。
第二税收价格没办法确定。我们是以课税对象价格来征税，商品价格是非常重要的，海关采取的也是成交价格估价法，都是需要纸质票据的支持。跨境电商一般没有纸质票据，这样就给海关监管税收增加了额外的难度。而且跨境电商的产品样式比较多样化，例如有形和无形产品等，海关征收税款也很难鉴定，这也增加了税收的难度。再一个就是税收监管漏洞较多。
第三是国家对“海淘”等没有有效的征管措施。监管力度不严格，大部分海淘的人为了更多利益，通常选择的是私人邮寄包裹等。如果按照规定需要备案，也在无形中增加了海关工作的压力。部分个人海外代购携带商品逃税的案例也数不胜数。
对我国出口跨境电商税收存在的问题，有以下几点不成熟的建议，可以为之参考。
1. 明确跨境电商企业的法律责任。明确各个环节参与人的法律责任，包括跨境电商企业，在线交易平台，物流，支付企业，购买人收件人等。
2. 建立完善的跨境电商税收征管制度。
3. 建立信息化监管系统。例如收件人的真实身份，产品的信息，支付信息等等。并且可以使用二维码技术明确产品信息。
4. 完善税法。从实际情况出发，保证跨境电商的发展同时，对税收后政策进行完善。
5.明确交易步骤。把票据电子化，交易分为各个步骤，每个步骤有各自的票据，按步骤缴纳费用，最终系统自动生成总票据。
